为了探索基于COⅠ基因的DNA条形码技术在鼠类鉴定中的应用，本研究检测了黑瞎子岛地区2科3属4种41只鼠类的COⅠ基因序列，进行比对分析，基于Kimura双参数模型计算种内种间遗传距离，用NJ法构建系统发育树，结果表明种间遗传距离显著大于种内遗传距离，聚类分析表现为很短的种内分支和较长的种间分支，同种个体聚为高支持度的单一分支。5只红背Clethrionomys rutilus 被误判为棕背 Clethrionomys rufocanus，24只莫氏田鼠Microtus maximowiczii被误判为东方田鼠Microtus fortis，1只大林姬鼠Apodemus peninsulae被误判为东方田鼠。研究结果表明， DNA条形码不仅能够纠正形态学鉴定中的错误，还能鉴别形态相近的近缘种。基于COⅠ基因的DNA条形码技术能够方便、快捷、准确的鉴定鼠类。