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本研究首次将新型分子标记-靶位区域扩增多态性(target region amplified polymorphism,TRAP)引入到南美白对虾育种研究中,通过分析比较了模板DNA、PCRMIXbuffer、引物浓度以及循环参数等对TRAP-PCR扩增结果的影响,优化建立了南美白对虾TRAP-PCR反应体系。应用这个体系筛选得到了12个随机引物,这些引物与特异基因设计的特定引物组合后扩增能得到条带丰富的图谱。对扩增的带谱进行统计结果显示平均每个引物扩增条带数在40.43个,扩增得到的多态性条带平均在10