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利用我国A区省份2009－2015年科研投入与产出的平衡面板数据，比较同一窗宽不同窗口以及不同窗宽对决策单元效率的影响，结果表明在不同的窗宽中，高校科研效率呈现出逐渐下降的趋势；在同一窗口下．各个备份的科研效率变化较大；东部地区的总体效率值低于中部地区。总之，近年来政府加大高校科研活动的投入并没有得到相应程度的提高，我国高校的资源配置效率仍较低，科研活动效率有待提高。