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用低熔点琼脂糖包埋浓度为1×109~1×1010个/mL红曲霉原生质体液制备得到DNA胶块.经裂解和PMFS纯化后脉冲场电泳检测,胶块中的DNA片段长度在800kb以上,每个胶块DNA含量为8~13 μg.DNA胶块经脉冲场电泳去除小于600kb的非目的小片段后用限制性内切酶EcoR Ⅰ、BamH I、Hind Ⅲ作用,结果大部分能被酶解.可以用于BAC文库等大片段基因组文库的构建,为红曲霉功能基因组的研究奠定了基础.