地果的转录组学分析

来源 :热带亚热带植物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：snake_9655

【摘要】

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为探究地果(Ficus tikoua)的遗传变异特征,利用Illumina HiSeq-2500平台获取地果的基因表达谱。结果表明,共获得了197362个转录本,总长度和平均长度分别为114072125和577 bp

【作者】

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石登红王继玥白禹张婷刘燕欧阳柏成

【机构】

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贵阳学院生物与环境工程学院,贵阳学院数学与信息工程学院,贵州省山地珍稀动物与经济昆虫重点实验室

【出处】

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热带亚热带植物学报

【发表日期】

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2020年4期

【关键词】

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转录组地果 RNA-SEQ 差异表达基因 TranscriptomeFicus tikouaRNA-seqDifferential expression ge

【基金项目】

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This work was supported by the Project of China Scholarship Council(Grant No.LJF[2017]50863),the Program for National Innovation Training of Undergraduate(Grant No.2018109760007,2018109760008),the Pro

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为探究地果(Ficus tikoua)的遗传变异特征,利用Illumina HiSeq-2500平台获取地果的基因表达谱。结果表明,共获得了197362个转录本,总长度和平均长度分别为114072125和577 bp。使用BlastX和BlastN共注释了139992个转录本(占总数的70.93%)。从3个品种叶片和茎的6对样品中,分别鉴定了12397、12340、10373、94431、71830和44465个差异表达基因,以及注释了126、129、125、134、138和137条代谢途径。这将有助于理

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