拟南芥miRNA及其靶序列配对特征分析

来源 :中国农业科技导报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaobailxiaoyi
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microRNAs(miRNAs)是真核生物中一类长度约为22 nt的非编码小分子RNA,miRNA与AGO等蛋白形成RISC沉默复合体,通过剪切或翻译抑制对靶基因起负调控作用。对拟南芥miRNA序列及其配对的靶序列间的特征进行了统计分析,结果表明miRNA序列5′端富含A、U,第1、第19碱基位对U、C具有较强的倾向性;miRNA与靶序列间常有1~4个碱基错配,错配碱基常出现在第1,第2和第21位,而第3~第6,第9~第10,第16~第17碱基配对较为保守,为人工合成miRNA的设计及miRNA靶基因的
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