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千瓣莲是中国独特的荷花资源。为阐明其品种资源间遗传关系。利用16条随机引物对来自云南省的5份农家品种和湖北当阳玉泉寺的1份千瓣莲资源进行了RAPD分析。16条引物共扩增出141条谱带,其中多态带81条,占57.45%;6份千瓣莲之间遗传距离较远。千瓣莲在中国具有较丰富的遗传多样性,并存在较大遗传分化;玉泉寺千瓣莲品种与云南省品种之间没有明显遗传分化;云南省内地方品种间存在较大分化,其中姚安千瓣莲最特殊。