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采用49对表达序列标签-微卫星标记（EST-SSR）引物对76份木薯材料（39份新引进材料和37份原始材料）进行遗传多样性分析，共获得135个多态性位点，每对引物检测等位基因数为1～4个，平均为2．75个；扩增产物的片段大小范围在250-750bp之间。根据遗传相似系数的聚类分析将所有材料分为5组，即A、B、C、D和E组，其中A、C、D、E4个组均为新引进种质，B组以0．6250为阈值，又将其分为5个亚组，其中B1、B2除了个别外，均为新引进种质，B2来自非洲，而B3、B4和B5主要为原有种质和育种品系。