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本文对《中华人民共和国种子法》(以下简称《种子法》)修订后在农作物种子生产经营许可方面新增的“两证”合一制度、育繁推一体化制度以及转基因农作物生产经营许可的新规定进行介绍,并对在新规定下目前仍出现的经营不再分装的种子存在不合法行为、无证经营行为惩治力度不明确和非主要农作物不要求取得生产经营许可证会产生的问题进行探讨,最后通过完善法律法规、加强监督管理和对生产经营者行为进行规制3个方面提出建议,旨在为解决上述问题和维持农作物生产经营许可制度的施行。