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目的
探讨膝关节滑膜成纤维细胞在类风湿关节炎发生、发展过程中的作用及在发病过程中起重要作用的通路。
方法在公共数据库NCBI GEO和EBI ArrayExpress中，通过查找关键字进行数据检索，筛选出符合要求的全基因组表达谱芯片数据。对收集到的mRNA芯片表达谱数据进行整合，采用GeneSpring软件进行数据的归一化，通过SAM方法确定差异表达基因和差异表达倍数。使用在线工具DAVID和STRING对差异表达基因进行功能富集和互作分析。
结果通过数据检索共发现符合要求的公共数据集2个，比较患者和健康人群膝关节滑膜成纤维细胞的表达谱后确定显著差异表达基因336个，其中患者组显著下调基因261个、显著上调基因75个。细胞外基质的编码基因占所有显著下调基因的13.6%。透明软骨的重要成分COL9A3，组成基底膜的COL4A5，以及WNT基因家族成员WNT2、WNT11、WNT16都有不同程度的表达下降。能够降解Ⅱ型胶原的基质金属蛋白酶13（matrix metalloproteinase 13，MMP13）表达量显著上调，它可能直接参与了软骨组织降解，也可能与其他蛋白互作来调节细胞生长。
结论通过对公共数据的挖掘揭示了细胞外基质降解在类风湿关节炎病情发展中的重要作用：MMP13、WNT2、WNT11、WNT16、COL9A3、COL4A5与细胞外基质、软骨关节合成、降解有关的基因可能成为类风湿关节炎治疗的靶标。