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三亚湾珊瑚可以分为５个微相：生物骨架岩、生物屑、礁岩屑、珊瑚碎块，强烈改造的生物质，成岩作用包括同生沉积作用、胶结、藻缠结、细粒物充填，机械和化学侵蚀。排浦更新世白云岩与掘穴生物的钻孔有关，粉至中晶结构为混合水成因，峨曼更新世灰岩为砂质灰岩、角砾状灰岩，豆状灰岩。生物屑经重结晶，Ｘ（ＭｇＣＯ３）小于２％，贫铁，三亚湾潮间带海滩岩胶结物为文石和高镁方解石，见悬挂式胶结和渗滤砂。