利用SSR标记探讨甜菜登记品种的取样策略

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本试验研究甜菜登记品种的取样策略,探讨多少样本数量能代表甜菜品种的总体遗传多样性水平。利用SSR分子标记对5个甜菜品种进行遗传多样性分析,采用18对甜菜SSR核心引物对处理方式不同的样本进行扩增,通过非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,比较单株、单株混合样本及其随机混合样本扩增的等位基因数目并分析品种的各项遗传参数。结果表明:(1)5个甜菜品种单株间具有一定的遗传变异,建立的技术体系可用于大多数甜菜品种的遗传多样性研究。(2)一般情况下单株混合样本可以扩增出单株DNA的全部带型,但部分在5、40和50株混样的情况下会出现漏检,10~30株混样基本一致,因此混合取样量在10~30株之间较为合理。(3)在不同梯度下的单株DNA随机混合样本的扩增带型及遗传参数分析中,发现随着样本容量的增大,有效等位基因数Ne、Shannon’s信息指数I、Nei’s期望杂合度He趋于平稳,其中混合数为10时,指标间的标准差小于0.1,变幅最小。综上所述,以样本量和遗传参数的变化关系可以确认在用SSR技术构建甜菜品种指纹图谱时,10个单株混合提取的DNA样本,为最优取样策略。该研究为构建指纹图谱提供依据
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