【摘 要】
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AP2/ERF转录因子是一种在植物生长发育和(非)生物胁迫应答等过程中发挥重要作用的转录因子家族。本研究在绿豆全基因组范围内,利用生物信息学方法分析了AP2/ERF转录因子家族
【机 构】
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南阳师范学院河南省南水北调中线水源区生态安全重点实验室; 南阳师范学院河南省伏牛山昆虫生物学重点实验室;
【基金项目】
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南阳师范学院博士科研专项(2019ZX027)资助
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AP2/ERF转录因子是一种在植物生长发育和(非)生物胁迫应答等过程中发挥重要作用的转录因子家族。本研究在绿豆全基因组范围内,利用生物信息学方法分析了AP2/ERF转录因子家族的成员、结构功能和理化性质等信息。结果表明:绿豆AP2/ERF转录因子家族包含87个成员,划分为ERF、DREB、AP2和RAV亚家族,其中76个成员不均匀的分布在11条染色体上;不同亚家族基因结构差异较大,除高度保守的AP2/ERF结构域外还存在其它保守结构域;各成员的蛋白分子量介于13.99~75.40 k D,理论等电点介于4.87~9.72,可能不存在信号肽且均属于亲水性蛋白;α-螺旋和无规则卷曲是主要的二级结构原件,三级结构与二级结构预测结果基本一致;丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸是主要的磷酸化作用位点,不同成员具有不同数量和长度的固有无序化区域。该研究结果将为进一步研究绿豆AP2/ERF转录因子功能提供理论依据,同时也为绿豆品种抗逆改良提供了依据。
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