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介绍了基因表达式程序设计方法的基本原理,针对求解复杂函数模型反问题中经典GEP算法多样性表现不足,甚至出现早熟的问题,提出了一种基于动态变异算子的改进的GEP算法——IGEP算法,从理论上对该改进算法进行了复杂度分析和收敛性分析。通过求解复杂函数模型反问题的多个实验将改进算法与传统方法、神经网络方法、经典GEP算法进行了对比,结果表明:该方法建立的复杂函数反问题拟合模型比经典GEP方法、传统方法、神经网络方法得到的模型更加优秀。