【摘 要】
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利用常温与低温贮藏3个月的玉米杂交种种子进行标准发芽试验,取发芽7d玉米幼苗进行转录组测序分析,通过GO、KOG、KEGG数据库分析处理差异表达基因的功能和参与的调控路径.以常温贮藏处理为参考,对转录组测序数据进行比较,低温贮藏处理共获得35个差异表达基因,其中上调基因28个、下调基因7个.在GO功能注释分析中,有26个差异基因被注释,可为分为18个功能分类.KOG功能注释分析发现,这些差异表达基因共获得19个功能注释,涉及到8个功能类别.KEGG通路分析发现,共有23个差异表达基因注释到13个代谢通路中
【机 构】
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安徽科技学院农学院,安徽凤阳233100;中国农业科学院作物科学研究所,北京100081
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利用常温与低温贮藏3个月的玉米杂交种种子进行标准发芽试验,取发芽7d玉米幼苗进行转录组测序分析,通过GO、KOG、KEGG数据库分析处理差异表达基因的功能和参与的调控路径.以常温贮藏处理为参考,对转录组测序数据进行比较,低温贮藏处理共获得35个差异表达基因,其中上调基因28个、下调基因7个.在GO功能注释分析中,有26个差异基因被注释,可为分为18个功能分类.KOG功能注释分析发现,这些差异表达基因共获得19个功能注释,涉及到8个功能类别.KEGG通路分析发现,共有23个差异表达基因注释到13个代谢通路中,其中,谷胱甘肽代谢、抗坏血酸和肌醇代谢、甘油磷脂代谢等通路显著富集.低温贮藏处理玉米种子活力指数显著高于常温贮藏处理.通过两个处理转录组分析,RNA-seq数据揭示,谷胱甘肽、抗坏血酸和肌醇、甘油磷脂等中涉及的基因优先表达于低温贮藏处理中,表明LTS可以促进谷胱甘肽代谢,从而提高植物抗氧化性,同时可以提高玉米抗逆性.
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