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为分析不同品种不同生长发育时期山药块茎的相关差异基因,本研究选取毕克齐山药(细长型)与大和长芋山药(短粗型)为试验材料,采用cDNA-AFLP技术分离山药块茎生长发育差异片段.结果 表明,从256对引物组合中筛选出多态性较好的25对引物组合,扩增出689条多态性条带,其中获得的上调差异片段共304条.将这些片段进行二次扩增、反向Southern blot验证,筛选获得15条阳性差异片段.经克隆和测序,最终获得12条核苷酸序列.经BLAST比对和功能分析,其中9条差异表达的核苷酸均与植物生长发育相关,主要涉及信号转导、转录调控、蛋白质代谢、能量代谢等相关功能蛋白.这些蛋白基因可进一步用于功能验证和转基因研究.为揭示两种山药块茎形态差异的可能原因提供基础资料.