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目的探讨转录因子SETDB1、膜联蛋白A6(ANXA6)在膀胱癌患者中的表达水平及其临床意义。方法选取2012年5月至2013年5月于宜昌市第二人民医院进行手术治疗的53例膀胱癌患者,选取癌组织为膀胱癌组,另选取距癌组织边缘>5 cm的对应癌旁组织标本为癌旁组。采用qRT-PCR检测膀胱癌组织中SETDB1和ANXA6mRNA表达量,免疫组化法检测膀胱癌组织中SETDB1、ANXA6蛋白表达,Pearson法分析SETDB1、ANXA6之间的相关性。术后对患者进行5年随访,采用Kaplan-Meier法分析患者5年的生存情况。结果患者癌组织转录因子SETDB1 mRNA表达水平显著高于癌旁组织,ANXA6 m RNA表达水平显著低于癌旁组织。免疫组化结果显示膀胱癌组织中SETDB1蛋白阳性表达率(66.04%)显著高于癌旁组织(24.53%)(P<0.05),膀胱癌组织中ANXA6阳性表达率(43.39%)显著低于癌旁组织(84.90%)(P<0.05)。SETDB1在膀胱癌组织中的表达与性别、临床分期、浸润深度相关(P<0.05),ANXA6在癌组织中的表达与性别、临床分期相关(P<0.05)。Pearson法相关性分析显示SETDB1、ANXA6呈显著负相关;Kaplan-Meier分析结果显示SETDB1、ANXA6表达与膀胱癌患者无进展生存期(PFS)、总体生存期(OS)明显相关,SETDB1阴性表达PFS(54.36%)、OS(61.08%)显著高于阳性表达PFS(30.06%)、OS(38.77%),ANXA6阳性表达PFS(56.27%)、OS(65.09%)显著高于阴性表达PFS(33.14%)、OS(39.17%)。结论转录因子SETDB1在癌组织中高表达,ANXA6在癌组织中低表达,二者表达呈负相关,且与膀胱癌的发展与患者预后不良相关。