【摘 要】
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目的:通过网络药理学理论及分子对接探究黄芪治疗口腔鳞状细胞癌(Oral Squamous Cell Carcinoma,OSCC)的可能机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)下载黄芪的有效成分及对应靶点,并通过癌症基因组图谱(TCGA)获取OSCC的差异表达基因集,筛选出的共同靶点即为黄芪治疗OSCC的潜在靶点。利用String数据库获取潜在靶点的相互作用关系,用Cytosca
【基金项目】
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广西科技基地和人才专项资助项目(NO.2021AC18031); 南宁市青秀区科技计划资助项目(NO.2021004); 广西医疗卫生适宜技术开发与推广应用资助项目(NO.S2021085);
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目的:通过网络药理学理论及分子对接探究黄芪治疗口腔鳞状细胞癌(Oral Squamous Cell Carcinoma,OSCC)的可能机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)下载黄芪的有效成分及对应靶点,并通过癌症基因组图谱(TCGA)获取OSCC的差异表达基因集,筛选出的共同靶点即为黄芪治疗OSCC的潜在靶点。利用String数据库获取潜在靶点的相互作用关系,用Cytoscape软件构建黄芪治疗OSCC的潜在靶点互作网络图,并获得关键靶点。通过注释可视化和集成发现数据库(DAVID)和KOBAS数据库分别对潜在靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析并构建“靶点-信号通路”网络图。借助Schrodinger软件对关键靶点及相应的黄芪有效成分进行分子对接。结果:黄芪可通过66个潜在靶点治疗OSCC,包括周期蛋白依赖激酶1(Cyclin Dependent Kinase 1,CDK1)、信号转导和转录活化因子1(Signal Transducer and Activator of Transcription 1,STAT1)、雄激素受体蛋白(Androgen Receptor,AR)、表皮生长因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR)和微囊蛋白1(Caveolin-1,CAV1)。黄芪治疗OSCC的潜在靶点富集最显著的是肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)信号通路、细胞衰老和P53信号通路。关键靶点AR和相关黄芪有效成分均有良好的结合活性。结论:该研究证明了黄芪治疗OSCC的多组分、多靶点和多通路特征,并为黄芪治疗OSCC的深入验证及黄芪在临床的合理应用提供科学依据。
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