猫科动物冠状病毒感染情况调查及其基因的进化分析

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为了解冠状病毒在猫科动物的感染情况,对采自上海某动物园的猫科动物144份样品进行检测,并对获得的阳性样品进行扩增和测序。结果显示:SARS-CoV-2荧光RT-PCR检测全部为阴性;FCoV荧光RT-PCR检测阳性3份。测序结果显示,检测到FCoV的ORF3、ORF7和S基因均呈遗传多样性,序列存在很大的个体间差异。3a、3b和3c基因主要表现为氨基酸突变。7a基因在第9位(F)、12位(V)和47位(S)均未发生氨基酸替换。它们均具有完整的7b基因。S基因的S1/S2裂解位点处有连续的R-R-S/A-R
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