志贺菌中成簇规律间隔短回文重复序列的分子分布特征

来源 :中华流行病学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sue001002
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目的

探索志贺菌中成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)的分布。

方法

共选择志贺菌分离株52株,其中河南41株,江西6株,北京5株。利用PCR扩增志贺菌的4个CRISPR位点(S1、S2、S3、S4),产物送测序,分析CRISPR的重复序列和间隔序列。

结果

志贺菌的4个CRISPR位点阳性率分别为33. 69%(S1)、50.00%(S2)、82.69%(S3)和73.08%(S4);S1和S3包括2种亚型,S2有3种亚型,S4包括4种亚型。2004年前分离的河南分离株中检出S1位点,2004年后分离的菌株中均未检出该位点;S2、S3和S4在两组的分布没有差异。

结论

志贺菌各CRISPR位点含有不同亚型,河南分离株S1的分布与细菌分离时间有关,而S2、S3及S4和分离时间无关。

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