【摘 要】
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目的通过颞叶癫痫差异发作频率转录组测序数据的分析,寻找与颞叶癫痫差异发作频率有关的关键功能基因及分子学机制。方法﹐从CEO数据库下载颞叶癫痫不同发作频率转录组测序数据CSE127871,使用R语言DESeq2包进行差异基因表达分析;使用R语言clusterProfiler包对差异基因进行基因本体论及京都基因和基因组百科全书通路富集分析;使用STRING数据库对差异基因进行蛋白质相互作用网络分析;使用Cytoscape软件从蛋白质层面筛选关键基因。结果―通过转录组数据进行差异基因表达分析,总共有820个差异
【机 构】
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山东第一医科大学（山东省医学科学院）临床医学院,山东第一医科大学（山东省医学科学院）生命科学学院
【出 处】
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山东第一医科大学(山东省医学科学院)学报
【基金项目】
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山东省医药卫生科技发展计划(2019WS391),山东第一医科大学学术提升计划(2019QL013),国家自然科学基金(32000477),山东省高校自然科学基金(J15LL07),泰安市科技局计划(2017NS0248)o。
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目的通过颞叶癫痫差异发作频率转录组测序数据的分析,寻找与颞叶癫痫差异发作频率有关的关键功能基因及分子学机制。方法﹐从CEO数据库下载颞叶癫痫不同发作频率转录组测序数据CSE127871,使用R语言DESeq2包进行差异基因表达分析;使用R语言clusterProfiler包对差异基因进行基因本体论及京都基因和基因组百科全书通路富集分析;使用STRING数据库对差异基因进行蛋白质相互作用网络分析;使用Cytoscape软件从蛋白质层面筛选关键基因。结果―通过转录组数据进行差异基因表达分析,总共有820个差异
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