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生物的进化过程是在其层与表型上同时进行的，表型层上的进化是以环境为参考的自然选择过程，而在基因层上则是一个带随机性的自我更新、自我优化的过程，而且在某种程度上具有自组织趋向，基于这种新的进化观点，本文提出了一种新的进化算法并将其应用于各种函数优化问题中。此算法不但考虑了表型层上的自然选择作用，还考虑了生物在基因层上的进化过程及两个层次间的相互映射关系。仿真结果表明，此算法不论在收敛速度、参数鲁棒性还是全局搜索能力上，都优于传统框架下的进化算法。