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肠道不仅是营养物质消化吸收的主要部位,也是重要的免疫器官和内分泌器官.小肠上皮细胞的分化对于肠道应激后的损伤修复、免疫屏障以及肠道功能的正常行使具有非常重要的意义.近年来,肠道上皮隐窝-绒毛轴干细胞自我更新、分化和调控的研究得到了快速发展.本文结合本研究组的研究成果综述了哺乳动物肠道隐窝-绒毛轴上皮细胞分化过程中差异基因和蛋白表达;信号通路、转录因子和表观遗传修饰对肠上皮细胞分化的影响以及营养因子对肠道细胞分化和损伤修复调控的最新研究进展,以期在营养学和药理学方面,为干预和治疗肠道损伤及相关疾病提供理论指导依据.