基于结构矩阵的DNA序列的相似性模型

来源 :数学的实践与认识 | 被引量 : 0次 | 上传用户：wujielele

【摘要】

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通过一维映射把DNA序列转化为时间序列,即把数字1,2,3,4分别分配给组成DNA序列的核苷酸A,T,G,C,用时间序列的结构矩阵来描述DNA序列的结构特征,并根据结构矩阵的一些性质定义

【作者】

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白凤兰佟晓梅

【机构】

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大连交通大学理学院

【出处】

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数学的实践与认识

【发表日期】

：

2004年期

【关键词】

：

DNA序列时间序列结构矩阵相似性度量

【基金项目】

：

辽宁省教育厅计划项目;

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通过一维映射把DNA序列转化为时间序列,即把数字1,2,3,4分别分配给组成DNA序列的核苷酸A,T,G,C,用时间序列的结构矩阵来描述DNA序列的结构特征,并根据结构矩阵的一些性质定义了结构矩阵的相似性度量,进而利用结构矩阵之间的相似性度量构建了比较DNA序列的相似性模型,以9个不同物种的β-球蛋白基因的第一个外显子(表1)为例验证了该模型的适用性.并得到了较好得结果.

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