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比较分析了嗜热泉生古细菌（Aeropyrum pernix K1）和其他两种系统发育相关的泉古菌[嗜气菌（Pyrobaculum aerophilum str．IM2）和嗜硫菌（Sulfolobus acidocaldarius DSM 639）]的同义密码子使用偏向性。结果表明嗜热泉生古细菌（Aeropyrum pernix K1）的密码子偏向性很小，并且与GC3s成高度的相关性。这3种泉古菌的密码子使用模式在进化上很保守。与基因的功能对密码子使用的影响相比，这些泉古菌密码子的使用偏向性更是由其物种所决