【摘 要】
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为了揭示核桃Alfin-like家族在核桃响应低温胁迫中的作用,本研究通过生物信息学与RNA-seq结合的方法,在核桃全基因组数据库搜索Alfin-like家族基因,对该家族进行生物信息学和转录表达分析。结果表明,核桃Alfin-like基因家族包含8个成员,分布在5条染色体上,蛋白长度范围为240(JrAL5)~254(JrAL1)个氨基酸,开放阅读框为723(JrAL5)~771 bp(JrAL3),等电点为5.04~5.71,全部为酸性不稳定蛋白;含有典型的DUF3594 Domian和PHD do
【机 构】
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河北省农林科学院植物保护研究所,河北农业大学山区研究所/河北省山区农业工程技术研究中心/国家北方山区农业工程技术研究中心,河北农业大学园艺学院
【基金项目】
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国家重点研发计划项目(2019YFD1001603),河北省自然科学基金资助项目(C2019204270),现代种业科技创新专项(21326352D)。
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为了揭示核桃Alfin-like家族在核桃响应低温胁迫中的作用,本研究通过生物信息学与RNA-seq结合的方法,在核桃全基因组数据库搜索Alfin-like家族基因,对该家族进行生物信息学和转录表达分析。结果表明,核桃Alfin-like基因家族包含8个成员,分布在5条染色体上,蛋白长度范围为240(JrAL5)~254(JrAL1)个氨基酸,开放阅读框为723(JrAL5)~771 bp(JrAL3),等电点为5.04~5.71,全部为酸性不稳定蛋白;含有典型的DUF3594 Domian和PHD do
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