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目的
观察微小RNA(miRNA,miR)-chr1011在肝癌组织的表达并分析其对肝癌患者的临床意义。
方法高通量深度测序分析6对肝癌组织中的小RNA序列,miRdeep 2.0.0.5软件比对基因数据库和预测新的miRNA,Northern blot验证新miRNA的结构及真实性,实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测62对肝癌组织的新miRNA表达,分析其与患者临床资料的关系。
结果miR-chr1011存在于人肝组织和肝癌细胞系,具有稳定的前体结构,位于人染色体chr10.11:107803675-107803737:+,Northern blot实验验证其在HCCLM3和Huh7肝癌细胞中表达。在62对肝癌组织中,miR-chr1011的癌旁组织表达量高于配对的癌组织(4.37±0.31比2.81±0.21,P< 0.01),同时miR-chr1011的表达量与肿瘤的巴塞罗那分期、TNM分期和门静脉癌栓(PVTT)的形成相关(P<0.05)。
结论miR-chr1011低表达于肝癌组织中,与肝癌患者预后明显相关。