“十一五”期间，我国综合交通运输建设的重点是：加快铁路的建设速度和扩大规模，加强能源运输大通道，集装箱运输系统的建设；在大的经济圈间注重建设结构合理的运输大通道，扩大运输能力，特别是城市群间快速旅客运输专线的建设；在经济圈内要加强城际快速轨道交通系统的建设；要重视与东南亚、东北亚和中亚地区的地面交通建设；要认真解决大城市交通堵塞现象，重视城市轨道交通的建设；要重视农村交通的建设。同时，要加强交通枢纽和综合交通信息网络建设，构建现代化的智能交通系统。
　　港口与水运受宏观调控、重点物资运输需求增势减弱，以及进出口贸易增长趋缓的影响，港口业从2004年的高增长转为2005年的相对稳健增长。但局部地区、个别港口、局部时段仍有一定程度的压船、压港现象。近年来，我国水路客运地位持续下降，水路货运地位不断上升。同时，水路客运向旅游、休闲方向转变，其中渤海湾水路客运表现兴旺。当前港口建设的重点是加快煤油矿箱四大货种专业化码头建设，加快20万吨以上原油接卸码头以及沿海和长江口内20万吨级以上矿石码头建设。未来五年，我国将在长江三角洲、珠江三角洲和渤海湾区域建设三大港口群，着重发展大型集约化和专业化码头，港口业仍具有较好投资前景。
　　铁路2005年全国铁路运输生产指标再创历史新高，旅客周转量、货物发送量、货运密度和换算周转量等主要运输指标均位居世界第一。但铁路运力紧张形势依然十分突出，黄金周特别是春运铁路客运能力不足问题仍很严峻。铁路行业是我国交通运输行业中瓶颈最大、市场化程度最低的行业。2006年，我国铁路建设计划投资1600亿元，第六次大提速也将准备就绪，铁路行业市场化改革进一步推进。从2005年到2020年，国家将投入两万亿元资金进行铁路建设，平均每年投资1000亿元以上，这将驱动铁路行业加速发展。
　　民航2005年，我国民航运输市场继续保持稳定增长，全行业航空运输总周转量、旅客运输量和货邮运输量分别达到259.2亿吨公里、1.38亿人次和306.75万吨，同时客货运输继续向大型机场集中。几年来，我国机队规模迅速扩大，据预测到2010年，全国民航运输飞机总量将接近1600架。从“十一五”开始，中国民航将启动建设新一代民用航空运输系统的工程，并将实现2010年航空运输总周转量、旅客运输量和货邮运输量均比2005年翻一番以上的目标，航空运输、机场建设均具有良好发展前景。