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三维定量构效关系（３Ｄ－ＱＳＡＲ）是在定量构效分析中引入生物活性分子的三维结构信息。本文论述了三种典型的３Ｄ－ＱＳＡＲ方法的基本原理和应用，它们分别是分子形状分析（ＭＳＡ）、距离几何方法（ＤＧ）和比较分子力场分析（ＣｏＭＦＡ）。这些方法的成功应用，尤其是ＣｏＭＦＡ方法，为定量构效关系（ＱＳＡＲ）研究开辟了一个新的领域，使之能更精确地揭示药物－受体的作用机理。