【摘 要】
：
RNA结合蛋白(RBP)是一类伴随RNA调控代谢过程与RNA结合的蛋白质的总称.一种RBP可能存在多种靶标RNA,其表达缺陷会造成多种疾病.现有的方法大都是针对某种特定的RBP设计二分类模型,预测一条RNA是否可以与之结合.但这些方法没有考虑到不同RBP之间的结合相似性和关联性.对此,iDeepM利用多标签深度学习法进行了改进.此方法使用多标签技术和长短时记忆网络(LSTM),学习到不同RBP之间的结合相似性,预测一条给定的RNA与多种RBP的结合情况,但是该方法未能对RNA序列进行充分的特征学习和多标签
【机 构】
：
江南大学 人工智能与计算机学院,江苏 无锡 214122
论文部分内容阅读
RNA结合蛋白(RBP)是一类伴随RNA调控代谢过程与RNA结合的蛋白质的总称.一种RBP可能存在多种靶标RNA,其表达缺陷会造成多种疾病.现有的方法大都是针对某种特定的RBP设计二分类模型,预测一条RNA是否可以与之结合.但这些方法没有考虑到不同RBP之间的结合相似性和关联性.对此,iDeepM利用多标签深度学习法进行了改进.此方法使用多标签技术和长短时记忆网络(LSTM),学习到不同RBP之间的结合相似性,预测一条给定的RNA与多种RBP的结合情况,但是该方法未能对RNA序列进行充分的特征学习和多标签学习,预测精度较低.延续iDeepM多标签的研究方法,提出新方法RRMVL,首次使用RNA序列视角、氨基酸序列视角、RNA序列语义视角和多间隙二肽成分视角组成多视角数据来处理多标签RBP识别问题.为了利用多视角数据的不同学习优势,融合四种视角提取到的深度特征,使用逻辑回归原理对它们进行多标签特征学习,将学习后的加权特征向量输入至链式多标签分类器中训练,使之达到最优多标签链式学习的效果.实验研究表明,融合多视角和多标签学习的RNA结合蛋白识别模型预测精度较之前使用单视角方法有了明显的提升.
其他文献
针对基于深度学习的人脸识别模型难以在嵌入式设备进行部署和实时性能差的问题,深入研究了现有的模型压缩和加速算法,提出了一种基于知识蒸馏和对抗学习的神经网络压缩算法.算法框架由三部分组成,预训练的大规模教师网络、轻量级的学生网络和辅助对抗学习的判别器.改进传统的知识蒸馏损失,增加指示函数,使学生网络只学习教师网络正确识别的分类概率;鉴于中间层特征图具有丰富的高维特征,引入对抗学习策略中的判别器,鉴别学生网络与教师网络在特征图层面的差异;为了进一步提高学生网络的泛化能力,使其能够应用于不同的机器视觉任务,在训练
人脸合成由于其应用与技术价值,是机器视觉领域的热点之一,而近年来深度学习的突破性进展使该领域吸引了更多关注。将该领域的研究分为四个子类:人脸身份合成、人脸动作合成、人脸属性合成与人脸生成,并系统地总结了这些子类的发展历程、现状,以及现有技术存在的问题。首先针对人脸身份合成,从图形学、数字图像处理与深度学习三个角度总结了各自的合成流程,对关键技术原理进行了详细的解释与分析。其次将人脸动作合成进一步分
为了应对冯·诺依曼计算架构的存储墙,存内计算(CIM)架构将逻辑嵌入到存储器中,在读取数据的同时完成运算,使存储单元具备计算能力并且减少了处理器和存储器之间的数据传输.为实现大容量、低成本存储器设计,提出了一种以双字线双阈值4T SRAM为基础的存储系统,不仅可实现数据的存储与读取,而且还可实现BCAM运算和与、或非、异或等逻辑运算.逻辑运算时,经译码电路任选两行存储数据,位线均预放电至低电平,位线电压通过位线端灵敏放大器与参考电压比较后输出运算结果.BCAM运算时,外部输入数据经译码电路译码后实现对存储
高性能且低功耗地进行大规模类脑仿真是类脑计算所需解决的最具挑战的问题之一.目前类脑计算的实现方式主要分为硬件实现和软件实现两种.通过硬件实现的专用类脑计算芯片与系统可以提供更佳的能效指标,但代价高、适应性差;基于软件方式的仿真(如NEST)拥有完整的应用生态,可用性好但存在计算速度慢的问题.如果将两种实现方式相结合,通过软硬件协同设计,可以在保证良好应用生态的同时获得更高的计算能效,提出了一种基于FPGA异构平台PYNQ集群的NEST类脑仿真器的高能效实现(PEST).通过构建大规模PYNQ集群,设计软硬
在基于位置的社交网络中,找到一个特殊的群体/社区是非常重要的.现在的研究都集中于寻找群体之间关系紧密的密集子图.相对于紧密的群体/子图,对于稀疏群的研究少之又少.虽然现有工作开始研究稀疏群体查询问题,但是还没有研究基于位置的稀疏群体查询问题,而基于位置的服务在现实生活中有很多需求.因此,研究基于位置的稀疏群查询的问题变得有研究价值.基于位置的稀疏群体查询是为了找到一群用户,不仅用户之间满足一定的稀疏性(即用户之间的社交距离大于k),且最小化用户到查询位置的距离和.针对这个问题,首先提出基于c-邻居的基本处
针对传统A~*算法在场景较大的栅格地图路径规划时,很多冗余节点的遍历导致寻路算法内存消耗大、计算速度慢等问题,提出了一种对A~*算法的改进策略。首先,改进启发函数的具体计算方式,利用切比雪夫距离替代欧氏距离使启发式函数精确地等于实际最佳路径,减少A~*节点的拓展数量;其次,使用跳点搜索(JPS)策略筛选出跳点添加到OpenList和ClosedList代替A~*算法中大量不必要的邻节点,通过跳点实
通过梳理我国2004-2019年不同地区近40份《政府投资项目代建制管理办法》(以下简称“《办法》”)并进行比较研究,归纳其中异同和变化趋势.结合实地访谈对国内典型城市的代建经验进行总结学习,提出政府投资项目代建制的完善建议,以规范代建模式发展和强化代建市场培育.
针对网络功能虚拟化环境中网络出现负载失衡的问题,提出一种拓扑与资源感知的虚拟网络功能迁移方法(TRA-VNFM).首先,根据底层网络的计算、存储和转发资源占用情况,设置两级动态阈值对物理节点的过载程度进行分类,同时制定相应的迁移判定条件并计算出待迁移目的节点集.其中高过载节点优先实施迁移且有更低的迁移成功条件.其次,针对过载节点上部署的虚拟网络功能,利用资源感知算法对其迁移权重进行设定,占用过载资源越多的虚拟网络功能迁移权重越大,结合迁移权重和资源需求选择出待迁移虚拟网络功能.最后,采用极值交互的拓扑感知
“十三五”规划的目标任务已经胜利完成.“十四五”规划进一步提出“坚持深化改革开放”的原则,坚定不移地推进改革、扩大开放.新的发展时期,我国建设工程咨询行业未来发展趋势是一个值得深入思考的问题.通过对国内外咨询行业发展现状的分析,结合目前国内咨询行业市场的发展环境,对我国咨询行业未来的发展方向进行预测,希望对建设工程咨询企业未来发展提供一些可供参考的观点.
持续突破创新前瞻业务多点开花rn成立于1993年的机械工业部第七设计研究院监理处,是国内较早开展工程监理服务的机构,1996年整体转制成立西安四方建设监理有限责任公司(以下简称“四方监理”),开始公司化运作.25年来,从初创艰难期直至如今辉煌发展期,四方监理站在时代的风口享受过政策与市场红利,也在市场经济的鞭策与磨砺中,见证了监理行业的发展.从与公司董事长杜鹏宇的对话中不难发现,四方监理能够取得今日的成功,与其审时度势、锐意改革、不断创新是分不开的.