【摘 要】
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【背景】鸽新城疫是由鸽Ⅰ型副黏病毒（Pigeon paramyxovirus type Ⅰ， PPMV-1）感染引起的危害最严重的疫病之一，至今尚无有效的防控制剂。【目的】分析鸽新城疫病毒BJ-C株的基因组信息及系统发育关系，为鸽新城疫的防控提供科学依据。【方法】设计首尾重叠的6对特异性引物，利用分段扩增的方法，以鸽新城疫病毒BJ-C株基因组cDNA为模板，分别扩增、测序后进行全基因组序列拼接。以
【基金项目】
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中国农业科学院创新工程计划（ASTIP-IAS15）；
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【背景】鸽新城疫是由鸽Ⅰ型副黏病毒（Pigeon paramyxovirus type Ⅰ， PPMV-1）感染引起的危害最严重的疫病之一，至今尚无有效的防控制剂。【目的】分析鸽新城疫病毒BJ-C株的基因组信息及系统发育关系，为鸽新城疫的防控提供科学依据。【方法】设计首尾重叠的6对特异性引物，利用分段扩增的方法，以鸽新城疫病毒BJ-C株基因组cDNA为模板，分别扩增、测序后进行全基因组序列拼接。以NCBI数据库中发布的新城疫病毒序列为参考，针对鸽新城疫病毒BJ-C株的基因组、F基因建立系统进化树。【结果】鸽新城疫病毒BJ-C株的基因组全长为15 192 nt。基于全基因组的遗传进化分析发现其与PPMV-1/BJ-01/CH株的遗传进化关系最近，核苷酸相似性为99.96%，氨基酸相似性高达100%，属于同一个分支，而与LaSota疫苗株等其他新城疫毒株的亲缘关系相对较远。基于F基因序列的系统发育树分析发现BJ-C株F基因与我国的BJP2013株同属一个分支。ClassⅡ类Ⅵ亚型F基因高变区序列（47-420 nt）比对结果显示，安徽株Pigeon/Anhui/2369/2012、广东株Pigeon/Guangdong/GZ288/2013、北京株BJP13、浙江株Pigeon/Zhejiang/2036/2012及比利时株PPMV-1/Belgium/11-09620/2011等与BJ-C毒株处于同一个分支，同属Ⅵb亚型。【结论】本研究获得了鸽新城疫病毒BJ-C株全基因组序列，分析了其系统发育关系，确定其属于ClassⅡ类Ⅵb型，为后续防控产品的开发提供了理论依据。
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