PAMAM和Amyloid蛋白相互作用的计算模拟

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采用粗粒化的分子动力学模拟研究了Amyloid蛋白对树枝形分子(PAMAM)的影响, 计算了在酸性和中性两种不同pH下,PAMAM分子与Amyloid蛋白不同距离下的回旋半径, 形状因子以及径向分布函数. 经分析发现Amyloid蛋白对PAMAM分子有较大影响,但树枝形分子内部空间不足以包裹Amyloid蛋白分子.自由能计算结果表明酸性pH条件下PAMAM分子无法吸附到Amyloid蛋白分子表面,而中性条件下二者却能形成稳定复合结构.
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