【摘 要】
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从金针菇菌株L11基因组数据筛选出一个腺苷酸合成酶超家族基因Fv-Afe1。结合转录组数据分析基因结构,利用生物信息学软件对基因及其氨基酸序列生理生化指标进行预测,与NCBI已
【机 构】
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福建农林大学菌物研究中心,中国科学院微生物研究所
【基金项目】
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国家重点基础研究发展计划(2014CB138302)
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从金针菇菌株L11基因组数据筛选出一个腺苷酸合成酶超家族基因Fv-Afe1。结合转录组数据分析基因结构,利用生物信息学软件对基因及其氨基酸序列生理生化指标进行预测,与NCBI已公布的其他物种的氨基酸序列进行系统发育分析,运用qRT-PCR技术和转录组表达谱数据对Fv-Afe1在金针菇各发育时期进行表达分析。结果显示,Fv-Afe1全长为967 bp,具有4个外显子和3个内含子,该基因氨基酸三级结构具有两个结构域,属于胞内酶,无跨膜结构,为真菌腺苷酸合成酶超家族成员;该基因在伸长期菌柄高表达,成熟期菌柄次之
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