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卵菌同一些植物病原真菌一样,具有明显的菌丝、附着胞、吸器以及孢子等形态特征,因此被划分到真菌界。但是现代分子和生化分析表明,卵菌与丝状真菌的亲缘性很小,但与真核生物重要的一界——原生藻菌界中的褐藻(不等鞭毛藻)和硅藻亲缘关系很近。植物病原卵菌可引起多种作物、观赏植物和本地植物毁灭性病害。