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巫山境内已知的鱼类有9目、22科、174种,大宁河鱼类资源尤为丰富。葛州坝工程截流蓄水后,水域生态环境渐渐变化,一些鱼类产卵场逐渐减少或消失。至三峡工程蓄水前,鱼类种群资源进一步减退,唯有圆口铜鱼,长须铜鱼,长鳍吻等鱼类种群较为稳定。三峡工程蓄水后,多数鱼类一时难以适应,飘游水体上层中。到8至9月,部分鱼类,特别是鲶鱼,暗鳜、鲢鱼等种群恢复增殖迅速。青鱼,草鱼、三角鲂、长春鳊、红鮊等苗种开始出现。