【摘 要】
：
目的基于生物信息学分析胃腺癌组织中微小RNA(miRNA)差异表达情况,寻找可作为胃腺癌生物标记物的miRNA。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载胃腺癌相关数据集,分析肿瘤
【基金项目】
：
国家自然科学基金资助项目(81703560);辽宁省教育厅一般项目(LK201618);辽宁省科技计划项目(2014226033);辽宁省沈阳市科技计划项目(17-123-9-00);辽宁省沈阳市科技计划项目重点实验室专项(F16-094-1-00)
论文部分内容阅读
目的基于生物信息学分析胃腺癌组织中微小RNA(miRNA)差异表达情况,寻找可作为胃腺癌生物标记物的miRNA。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载胃腺癌相关数据集,分析肿瘤组织与正常组织之间miRNA的表达差异。利用Kaplan-Meier曲线进行患者生存分析,筛选具有潜在生物标记物性质(高表达、预后差)的miRNA。利用生物信息学预测miRNA的靶基因,通过基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)进行基因富集分析,以判定差异基因主要影响的生物学功能或者通路。结果 TCGA数据库分析结果发现,相对于45份正常组织,446份胃腺癌组织中存在319个差异表达miRNA,其中下调95个、上调224个。进一步通过生存分析筛选出6个高表达、与预后有关的miRNA(miR-217、miR-216a、miR-200b、miR-1911、miR-675、miR-96),其中miR-217高表达者预后差。胃腺癌组织中miR-217表达量为303.2±55.16,高于正常组织中的84.82±13.42(P<0.001)。通过Targetscan和miRDB生物信息预测软件对miR-217潜在靶基因取交集,获得151个有效靶基因;GO和KEGG分析结果显示,miR-217的这些靶基因与调节细胞凋亡、细胞周期、大分子代谢、蛋白酶的活性密切相关。结论利用生物信息学分析发现,与正常组织比较,胃腺癌组织中存在miRNA的差异表达;其中miR-217在胃腺癌组织中表达上调,通过调控靶基因参与相关的信号通路而导致患者预后不良,可成为胃腺癌的生物标记物。
其他文献
放射性核素铀作为核燃料和核武器的装料被广泛应用于核工业生产和军事领域,且自1991年海湾战争以来,贫铀还被制造成贫铀穿甲弹和装甲坦克等贫铀武器应用于战争中,而2011年日
对2006年-2010年SCIE、EI、CPCI-S和CSTPCD数据库收录的西北农林科技大学科技论文的篇数、被引次数以及在中国大陆高校排名情况进行了统计分析。结果表明,近5年,学校科技论文
目的观察一贯煎合大补阴丸联用美多巴治疗帕金森病的临床疗效。方法对40例冠心病患者，随机单盲分为对照组20例，采用常规口服单用美多巴治疗；治疗N20例，采用一贯煎合大补阴丸联用
通过构建中国农区乡村和城镇化发展的评价指标体系和耦合协调评判模型,利用1992、2000和2010年三期分区统计数据,分析了中国九大农区城乡协调发展水平及时空演变特征。结果表
以菲克定律为基础,推导出可以普遍适用的染色动力学方程:-In1/1-α=K(t-τ)m和In In1/1-F(t)=InK+mIn(t-τ)K具有反应速度常数的性质,在图解法中为截距,m决定上染曲线的形状,
对当今形势下随着手机平板等移动终端迅猛发展,对高校图书馆电子阅览室造成影响调查分析,力图寻求图书馆电子阅览室自我救赎与发展。
以《应用生态学报》2009年--2011年载文作者为统计对象，对载文量、第一作者单位、职称、年龄、合著情况进行统计分析。结果表明：《应用生态学报》2009年～2011年共栽文1404篇，期均
目的 评价＂问题式教学法（Problem-Based Learining,PBL）＂在呼吸内科护理实习教学中的可行性及优越性.方法 将116名护理专业学生,随机分为两组,PBL教学56人（试验组）,另一组传统教学6
针对球墨铸铁件传统浇注时间计算公式的不足 ,提出有效浇注时间概念及其计算方法 ,并用统计学方法对其适用性进行了验证。
我国某核电厂核岛基坑边坡形状不规则,体形复杂,坡顶有较大吊装荷载,边坡采用预应力锚索＋腰梁进行支护.本文针对边坡的三维效应,采用三维弹塑性有限元强度折减法计算边坡的稳