目前省级重点实验室建设评价的研究工作大多停留在科研产出的统计与比较上，少见“投入-产出”间的绩效分析。本研究以福建省重点实验室为研究样本，通过计量模型定量分析实验室资金投入、劳动力投入、人力资本构成、对外学术交流情况等因素对实验室论文发表、专利授权、人才培养及经济收入的显著影响；对比研究高校科研院所重点实验室与企业重点实验室建设成效的差异；分析实验室的创新能力与当地经济发展水平间的相关性，研究福建省重点实验室创新绩效关系。结果表明：（1）年轻科研人员所占比重、高级职称人员所占比重、高端人才所占比重、学术交流次数，实验室所在城市的整体受教育水平与R&D投资水平均对论文产出有显著的正向影响。实验室承担项目经费与面积对专利授权有着显著的积极影响。高级职称人员及高端人才能显著增加硕博人才的培养。（2）实验室投入对经济产出整体上得到了相应回报。（3）高校科研院所重点实验室投入-产出的相关性远高于企业重点实验室，但成果转化仍存在不足。建议优化重点实验室评价体制，推动高校科研院所重点实验室与企业实质性的合作，提升创新成果的转化能力。