【摘 要】
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目的探讨不同组织保存状态(原始样本或基因组DNA)及保存时间对非小细胞肺癌(NSCLC)中表皮生长因子受体(EGFR)基因突变检测结果的影响。方法收集EGFR基因突变阳性NSCLC患者的
【机 构】
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首都医科大学肺癌诊疗中心,首都医科大学宣武医院胸外科
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目的探讨不同组织保存状态(原始样本或基因组DNA)及保存时间对非小细胞肺癌(NSCLC)中表皮生长因子受体(EGFR)基因突变检测结果的影响。方法收集EGFR基因突变阳性NSCLC患者的新鲜冰冻组织和石蜡包埋(FFPE)组织各10例,每保存1个月提取1次DNA(共12次),设为冰冻新提取组和FFPE新提取组;同时分别选取初检后剩余基因组DNA作对照,设为冰冻预留组和FFPE预留组。分别采用检测试剂盒定性和定量检测上述4组EGFR基因的突变情况,同时采用荧光定量PCR技术检测内参基因的Ct值。比较4组不同保存时间的内参基因Ct值和EGFR基因突变频度情况。结果 20例原始组织样本均可以检出EGFR基因突变,与临床信息相符。新鲜冰冻组织、FFPE组织的DNA浓度均>50ng/μl,且A260/A280为1.8±0.2。新鲜冰冻组织保存10个月后,冰冻预留组的内参基因Ct值高于冰冻新提取组,差异有统计学意义(P<0.05);FFPE保存12个月内,FFPE新提取组和FFPE预留组内参基因Ct值的差异均无统计学意义(P>0.05)。冰冻新提取组保存6个月后和FFPE新提取组保存4个月后的EGFR基因突变频度高于对应预留组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论原始样本相对于预留基因组DNA更适合用于回顾性研究的材料。
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