目的 探索Trp2等位基因多态性与中国汉族人群椎间盘退变性疾病(DDD)的关联.方法 采用"病例-对照"研究方法,对Trp2等位基因对应的的单核苷酸多态性(SNP)位点进行筛查.125例中国汉族DDD患者(DDD~+)与125例中国汉族非DDD受访者(DDD~-),其年龄、性别相匹配.提取外周血DNA,根据COL9A2基因在326位的氨基酸位置处存在两个突变位点,在NCBI基因序列数据库中确定其对应的位点SNP1(rs7533552)和SNP2(rs2077871).根据椎间盘退变程度、单节段或多节段退变、退变的节段分布,将DDD~+组为不同的亚型.用SNP分型系统-SNPstream UIT对所有样本的所选SNP位点行基因型鉴定.对检测数据分别行拟和优度χ~2检验、基于等位基因频率/基因型的关联分析.结果 病例组中和对照组中,两个位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡;病例/对照组中等位基因频率分别为:SNP1A=105(42%)/117(58%)、SNP1G=145(47%)/133(53%),SNP2C=220(88%)/30(12%)、SNP2T=224(90%)/26(10%);基因型频率分别为:SNP1AA=21(17%)/25(20%)、SNP1AG=63(50%)/67(54%),SNP1GG=41(33%)/33(36%);SNP2CC=95(76%)/100(80%)、SNP2CT=30(24%)/24(19%),SNP2GG=1(0%)/1(%1),差异均无统计学意义.进一步对候选基因与DDD~+组的不同亚型进行关联分析中,发现SNP2的基因型与椎间盘退变程度有相关性(χ~2=6.920,P=0.031).结论 中国汉族人群中,Trp2等位基因的基因多态性可能是决定椎间盘退变发展与退变程度的危险因素之一。
中国汉族人群Trp2等位基因多态性与椎间盘退变性疾病的关联分析
【摘 要】
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目的 探索Trp2等位基因多态性与中国汉族人群椎间盘退变性疾病(DDD)的关联.方法 采用"病例-对照"研究方法,对Trp2等位基因对应的的单核苷酸多态性(SNP)位点进行筛查.125例中国汉族DDD患者(DDD~+)与125例中国汉族非DDD受访者(DDD~-),其年龄、性别相匹配.提取外周血DNA,根据COL9A2基因在326位的氨基酸位置处存在两个突变位点,在NCBI基因序列数据库中确定其对
【机 构】
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300121,天津市人民医院脊柱外科,中国医学科学院,中国协和医科大学,北京协和医院骨科,中国医学科学院,中国协和医科大学,北京协和医院骨科,中国医学科学院,中国协和医科大学,北京协和医院骨科,中国医
【出 处】
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中华医学杂志
【发表日期】
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2010年90期
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