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2006年8月13日至20日，江苏省南京市出现了持续高温天气，而这一段时间正是一些杂交中籼稻的孕穗、抽穗、扬花期。进入9月份，六合区部分田块的水稻出现了结实差、秕粒增多的现象，不明原因的种植农户和基层经销商，把这种现象简单地归结为种子的质量问题。实际上2003年7月25日至8月7日，该地区曾经持续出现创记录的高温天气，当时六合区马集镇、竹镇、雄州镇种植的杂交中籼稻发生了大面积空瘪。