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针对目前国内市场销售的医疗免疫检验设备主要是来自于国外进口、价格十分昂贵等现状,自主研发了一套全自动荧光分析仪系统,详细介绍了其FPGA/DSP运动控制+PC+STM32嵌入式微处理单元一体化的硬件结构设计、基于C#多线程的软件系统、双机制通信设计及其实现;通过精简硬件结构、合理硬件选型以及采用面向对象技术开发控制系统软件,控制系统精度和速度得到显著提高。最后进行了整机测试验证,说明该控制系统在功能、性能和成本上满足了全自动荧光分析仪的需求。