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AGAMOUS (AG)基因是调节植物开花的基因。本研究根据水曲柳转录组数据筛选出与开花相关基因，通过RT-PCR方法扩增，得到水曲柳AG基因序列，命名为FmAG，并利用生物信息学手段对获得的序列进行结构及功能预测，结果表明，水曲柳AG基因编码区全长726 bp；蛋白质分子量为27 913.51，具有典型的MADS-box结构域和K-结构域，是一个无信号肽、无跨膜区、亲水性、不稳定蛋白，二级结构由148个α-螺旋组成，系统进化树分析显示该蛋白与Fraxinus nigra、Fraxinus pennsylvanica的AG同源蛋白亲缘关系最近，进一步确定所获得的序列为AG基因。本研究为今后通过基因调控分子育种和促进水曲柳优树种源有性繁殖奠定基础。