【摘 要】
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为探讨云茶1号茶树品种优异性状的遗传基础,采用PacBio平台进行全长转录组测序,最终获得Polishedconsensus序列213389个,预测到CDS有223120个,检测到195062个SSR位点。在NR数
【机 构】
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云南省农业科学院茶叶研究所,云南省茶学重点实验室
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(31660224、31560220、31460216)、云南省人才培养计划项目(2015HB105)
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为探讨云茶1号茶树品种优异性状的遗传基础,采用PacBio平台进行全长转录组测序,最终获得Polishedconsensus序列213389个,预测到CDS有223120个,检测到195062个SSR位点。在NR数据库有170264个同源序列比对到980个物种;有103124个在KOG数据库得到注释,根据其功能各分为26类;有65524个得到GO注释分为细胞组分、分子功能及生物学过程等三大类的55个功能组;根据KEGG数据库,105972个得到了注释,涉及到216个代谢途径分支,包括茶叶品质、活性物质代谢
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