在新疆维吾尔自治区内,不同地区的维吾尔族呈现不同颜色的眼色,以黑褐色为主,平均出现率为90.45%;各类浅颜色眼色(天蓝色、灰色、浅绿色、浅黄色)均有一定的出现率,平均出现率为9.55%。从东部(哈密地区)到西部(喀什地区),浅颜色眼色出现率逐渐增加。维吾尔族眉毛生长发育较好,有较高的连眉发生率,从东部到西部眉毛生长逐渐浓密,连眉发生率逐渐增加。上眼睑皱褶表型频率较高,平均62.07%,从东部到西部逐渐下降。内眦褶表型频率平均48.63%,从东部到西部逐渐减少。维吾尔族的眼部特征具有明显的本民族特点,各项指标均介于北亚蒙古人种和欧罗巴人种之间。不同地区的维吾尔族眼部特征表现出一定的差异,并呈从东部到西部逐渐变化的趋势。维吾尔族所表现出的眼部特征与近现代维吾尔族形成的人种构成和演化过程相吻合。