【摘 要】
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目的通过生物信息学分析环状RNA在胃癌中的作用,以期寻找新的肿瘤标志物。方法从GEO数据库中检索并下载胃癌组织的芯片数据,利用GEO2R在线分析工具在线分析并筛选出差异表达
【机 构】
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徐州医科大学研究生院,南京医科大学第一附属医院普外科,南京医科大学附属肿瘤医院临床检验中心
【基金项目】
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国家重点研发计划(2016YEC0905900),国家自然科学基金(81872365),江苏省科技厅重点项目(BE2019731)
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目的通过生物信息学分析环状RNA在胃癌中的作用,以期寻找新的肿瘤标志物。方法从GEO数据库中检索并下载胃癌组织的芯片数据,利用GEO2R在线分析工具在线分析并筛选出差异表达的环状RNA。通过数据对比,提取差异表达一致的环状RNA,然后利用miRanda软件和RNAhybrid软件预测其与miRNAs之间的相互作用。通过TCGA数据库分析亲本基因在胃癌组织中的表达。结果通过对数据库GSE78092、GSE89143和GSE83521进行合并分析,发现差异表达的环状RNA共有498个,上调的环状RNA有125
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