【摘 要】
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为分离克隆幼苗期大豆根系重要功能的基因,丰富其理论,从大豆吉农18根系突变体的苗期根系中克隆GmSTPP-r基因的cDNA序列,对其编码的氨基酸序列、系统进化树、蛋白质理化性质
【机 构】
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吉林农业大学农学院,长春,130118
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为分离克隆幼苗期大豆根系重要功能的基因,丰富其理论,从大豆吉农18根系突变体的苗期根系中克隆GmSTPP-r基因的cDNA序列,对其编码的氨基酸序列、系统进化树、蛋白质理化性质、基因编码蛋白的亲疏水性、蛋白的二级结构、跨膜结构及信号肽、等进行了生物信息学分析,并与已报道的大豆丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶(XM_014764732)进行对比.结果如下:利用RT-PCR技术克隆得到长度为935 bp的目的基因片段GmSTPP-r.通过生物信息学分析得知该基因与水萝卜、藜麦间的亲缘关系较近.该基因编码305个氨基酸,是疏水性的碱性蛋白.二级结构预测显示具有α-螺旋(37.70％)、无规卷曲(29.84％)、延伸链区(25.25％)和β-转角(7.21％),无其他二级结构.该基因编码的蛋白不具有信号肽,且无跨膜结构.亚细胞定位预测该基因定位于线粒体内.本研究克隆了基因GmSTPP-r,为该基因进一步研究提供材料,同时利用生物信息学分析预测,为进一步分析鉴定该基因的功能提供理论依据.
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