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目的
探讨Toll样受体通路相关基因的遗传变异与胃癌及食管鳞状细胞癌易感性之间的关系。
方法运用adaptive rank-truncated product (ARTP)方法,从通路及基因水平分析中国胃癌及食管鳞状细胞癌高发人群的全基因组关联研究数据,运用非条件Logistic回归分析的additive模型分析通路相关单核苷酸多态性(SNP)与胃癌及食管鳞状细胞癌的关系。运用PLINK 1.07及SPSS 19.0软件进行一般的统计学分析,运用R3.0.2软件中 "ARTP" 程序包进行基因及通路水平分析。
结果在基因水平的分析中,发现 8个基因与胃癌易感性相关(P<0.05),6个基因与食管鳞状细胞癌相关(P<0.05)。在单个SNP水平的分析中,21个SNP与胃癌患病危险性相关有统计学意义(P<0.01),11个SNP与食管鳞状细胞癌患病危险性相关有统计学意义(P<0.01)。
结论某些TLR通路相关基因的遗传变异与胃癌或食管鳞状细胞癌患病危险性之间存在一定关联,需进一步研究其潜在分子机制。