目的：研究红曲发酵炮制对脾虚食积证小鼠的胃肠调节作用及其作用机制，为曲类中药的健脾消食作用机制探索新思路。方法：采用随机分组法将50只昆明小鼠分为5组，包括空白组、模型组、红曲未发酵组(1 170 mg·kg^-1·d^-1)，红曲发酵组(1 170 mg·kg^-1·d^-1)，多潘立酮组(3.9 mg·kg^-1·d^-1)，每组10只，连续灌胃给药10 d。对比红曲发酵炮制前后对脾虚食积证小鼠行为学、体质量、进食量、胃内残留率和小肠推进率的影响。采用酶联免疫吸附测定法（ELISA）检测红曲对脾虚食积证小鼠血清中胃动素（MTL），胃泌素（GAS），5-羟色胺（5-HT）和血管活性肠肽（VIP）水平的影响；利用苏木素-伊红（HE）染色法研究红曲对脾虚食积证小鼠胃肠组织形态学的影响；基于细菌16S rRNA基因序列的V3-V4区，通过高通量测序平台Illumina MiSeq研究红曲对脾虚食积证小鼠肠道菌群结构的调节作用。结果：与模型组比较，红曲发酵后可恢复脾虚食积证小鼠的体质量和进食量，显著降低胃内残留率（P<0.01）和显著升高小肠推进率（P<0.01）。红曲可增加脾虚食积证小鼠胃肠激素MTL和5-HT的水平，降低VIP水平；红曲能改善脾虚食积证小鼠胃肠组织形态，改善脾虚食积证小鼠胃黏膜的轻微充血和局部腺体排列不整齐，显著升高脾虚食积证小鼠小肠绒毛长度、增加小肠黏膜厚度；红曲可以恢复脾虚食积证小鼠肠道菌群结构，增加有益菌双歧杆菌属和乳酸杆菌属的相对丰度，降低有害菌大肠埃希菌-志贺菌的相对丰度。结论：红曲发酵后能调节脾虚食积证小鼠的胃肠功能，其机制可能与调节胃肠激素水平、改善胃肠组织形态、恢复肠道菌群结构有关。