西洋参PqGA2ox基因的克隆与序列分析

来源 :中草药 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liongliong599
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的克隆、分析西洋参Panax quinquefolium种子萌发过程的赤霉素2-氧化酶(gibberellin 2-oxidase,GA2ox)基因。方法从前期由高通量测序得到78207条unigenes基因的注释信息中挖掘出与赤霉素合成和分解代谢相关的基因序列,得到11条GA2ox基因相关序列,通过序列比对分析确定GA2ox的转录本。根据选定的unigene序列设计引物,采用PCR方法扩增西洋参GA2ox的cDNA全长;利用生物信息学方法分析所得基因,并用实时荧光定量PCR技术进行表达分析。结果得到一条长度为987bp,编码328个氨基酸残基的西洋参GA2ox基因,命名为PqGA2ox。生物信息学预测PqGA2ox蛋白不含跨膜区,不含信号肽,具有依赖于2-酮戊二酸和Fe2+的双加氧酶超家族的保守结构域。实时荧光定量PCR结果显示在形态休眠中期和生理休眠中期的表达量低于其休眠起始期和解除休眠期。结论首次获得西洋参种子PqGA2ox基因的编码区序列,为进一步研究西洋参种子解除休眠的分子机制奠定基础。 Objective To clone and analyze the gibberellin 2-oxidase (GA2ox) gene of Panax quinquefolium seed germination. Methods The gene sequences related to gibberellin synthesis and catabolism were excised from the annotation information of 78,207 unigenes genes obtained by high-throughput sequencing in the early stage. Eleven GA2ox gene-related sequences were obtained, and the transcripts of GA2ox gene were determined by sequence alignment . The primers were designed according to the selected unigene sequence, and the full-length cDNA of GA2ox in American ginseng was amplified by PCR. The gene was analyzed by bioinformatics method and analyzed by real-time fluorescence quantitative PCR. The results obtained a length of 987bp, encoding 328 amino acid residues GA2ox American ginseng gene, named PqGA2ox. Bioinformatics predicts that the PqGA2ox protein contains no transmembrane domain, no signal peptide, and a conserved domain that is dependent on the dioxygenase superfamily of 2-oxoglutarate and Fe2 +. The results of real-time PCR showed that the expression level in mid-term and mid-term dormancy was lower than that of dormancy and dormancy. Conclusion The coding region sequence of PqGA2ox gene in American ginseng seeds is obtained for the first time, which lays the foundation for further study on the molecular mechanism of American ginseng seed dormancy release.
其他文献
周麦28号小麦新品种是周口市农业科学院利用(周麦18/周麦22)为母本、周2168为父本复合杂交选育而成。2013年通过国家农作物品种审定委员会审定,审定编号为国审麦20130009。1
目前,国内天然气管网建设正在飞速发展,多气源、多用户、多分支的管道正在成为主流,管道运营公司经常面对接收不同组分和热值的气源进入到同一管道中的情况,为此需要对各个气
龙粳32由黑龙江省农业科学院佳木斯水稻研究所和黑龙江省龙粳高科有限责任公司育成。具有高产、优质、抗稻瘟病、耐冷等特点,2011年通过黑龙江省农作物品种审定委员会审定。
投资者利益保护是投资基金法律制度的核心。英国和美国对于投资基金投资者利益的保护都有着较为成功的经验,但两者的法律制度在基本模式、具体内容和组织机构等方面又有着较大
该文以海上拖航为研究对象,以中国的相关规定为法律基础,同时借鉴英、美等国的相关法律和实践,阐述了海上拖航中的某些法律问题,提出了中国拖航中应该改进的地方,以期对完善
我国个体、私营等非公有制经济作为社会主义市场经济的重要组成部分和促进社会生产力发展的重要力量,对经济增长、扩大就业、活跃市场、增加财政收入发挥着重要作用。改革开
紫花苜蓿为豆科苜蓿属草本植物,具有抗寒、耐旱、高产、营养丰富和适应性广等特性,是我国目前分布最广、经济价值最高的多年生牧草,有“牧草之王”的美誉。由于紫花苜蓿属于
学位
提单是承运人签发给托运人的用以证明货物已经接收或装船并据以交付货物的单证,.签发的单是船舶营运的重要的组成部分,也是航运与贸易相关联的重要环节,因此提单的签发具有十
全球化是20世纪的重要特征之一,它深刻地影响着每个国家的政治、经济与文化的发展和变迁。在全球化的进程中,政治发展面临着新的复杂情况。对全球化与政治发展的进程与互动进行