【摘 要】
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蛋白质交互关系(PPI)是生物医学领域的重要研究内容之一,目前通过生物医学实验得到的PPI信息主要以文本的形式存储在相关文献中。随着生物医学文献数量的飞速增长,人工识别PP
【机 构】
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南京航空航天大学计算机科学与技术学院,CCF
【基金项目】
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国家自然科学基金(61202132).
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蛋白质交互关系(PPI)是生物医学领域的重要研究内容之一,目前通过生物医学实验得到的PPI信息主要以文本的形式存储在相关文献中。随着生物医学文献数量的飞速增长,人工识别PPI的方式已经难以满足实际应用需求。文中采用基于弱监督的PPI识别基础框架,以少量有交互关系的蛋白质对作为种子集,通过对种子集的不断迭代扩充,最终实现蛋白质交互关系识别。相比于现有的其他方法,该方法仅需少量有标注数据实现了较好的识别效果,节省了大量人力物力。在此基础上,利用词向量对现有的表达交互关系的关键词进行扩充,并对关键词的可靠性进行
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